La cripta, conocida como «Os Fornos», se relaciona con los llamados «monumentos con horno y piedra formosa», propios de la etapa final de la cultura castrexa del noroeste. La tradición sitúa aquí el martirio de la Santa Mariña, condenada a morir abrasada y a que San Pedro sacó por un pequeño agujero en la parte superior del horno.
Esta planta solo la integran tres estancias: la primera cubierta con una bóveda de cañón apuntada que por su decoración semejante a la del Santuario hace pensar en una cronología del siglo XIII; las laudas de diversa tipología y formato debieron ser anteriores a esta construcción; en el ángulo SO una especie de piscina pétrea recoge aguas de una hendidura abierta en el muro.
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